Der Wagenladungsverkehr wurde über mehr als 10 Gleisanschlüsse abgewickelt. Für den Stückgutverkehr waren zwei Ladegleise und eine großeGüterumschlaghalle vorhanden. Wo früher die Güterhalle stand befindet sich heute der Busbahnhof.

Einer der letzten Rationalisierungsmaßnahmen beim Bahnhof Neumarkt dürfte der Wegfall des 54 Jahre alten Drucktastenstellwerkes (Dr-Stellwerk) im November 2005 gewesen sein.

Diese Anlagen zählten in den 50er Jahren zu den modernsten technischen Errungenschaften.

Als Ersatz wurde ein neues elektronisches Stellwerk in Betrieb genommen, das zentral von München aus gesteuert wird.